ĐA HÌNH NUCLEOTIDE ĐƠN GENE HIGH-AFFINITY POTASSIUM TRANSPORTER 1;4 (OsHKT1;4) CỦA MỘT SỐ GIỐNG LÚA (ORYZA SATIVA) Ở ĐỒNG BẰNG SÔNG CỬU LONG

Abstract

Tách chiết và thu nhận được DNA tổng số của 15 mẫu thân lá cây lúa (Oryza sativa) trồng tại các vùng có độ mặn khác nhau ở Đồng bằng sông Cửu Long. Thiết kế và sàng lọc thu được các cặp mồi đặc hiệu HKT1;4-1, HKT1;4-2, HKT1;4-3 khuếch đại các vùng mã hóa gene OsHKT1;4 của cây lúa bằng kỹ thuật PCR. Giải trình tự, ráp nối và chú thích thành công gene OsHKT1;4. Gene OsHKT1;4 của các giống lúa (Oryza sativa) Bến Tre, Tiền Giang, Long An sống trong môi trường nước lợ, độ mặn từ 2,4 đến 4,0 ppt có các đột biến điểm thay thế SNP ở vùng mã hóa làm thay đổi amino acid valine (V) thành glycine (G) hoặc tyrosine (Y) thành serine (S), dẫn đến thay đổi cấu trúc protein OsHKT1;4 theo hướng tạo nhiều kênh SG³ để loại bỏ Na⁺ ra khỏi lá nhanh hơn. Gene OsHKT1;4 của các giống lúa (Oryza sativa) Vĩnh Long, Đồng Tháp trồng trong môi trường nước ngọt độ mặn từ 0,1 đến 0,3 ppt có các đột biến điểm SNP không làm thay đổi cấu trúc protein OsHKT1;4 theo hướng không tăng thêm kênh SG³ để loại bỏ Na⁺ ra khỏi lá chậm hơn