QUAN HỆ TIẾN HÓA CỦA CoVs DỰA TRÊN RBD

  • Quang Trương Thế
Từ khóa: phân chi Sarbecovirus; protein gai (S); sắp hàng nhiều trình tự RBD; tỷ lệ tương đồng

Tóm tắt

Thu thập 15 trình tự RBD của CoVs từ cơ sở dữ liệu GenBank (NCBI, USA). Sắp hàng nhiều trình tự CoVs RBD, xây dựng cây tiến hóa và nhận diện được ba phân chi CoVs là Sarbecovirus, Merbecovirus và Embercovirus. Phân chi Sarbecovirus có khoảng cách tiến hóa xa đối với Embercovirus 2,48226 và Merbecovirus 2,19391. Trong phân chi Sarbecovirus, human SARS-CoV2 và pangolin CoV có quan hệ tiến hóa gần nhau nhất với tỷ lệ tương đồng từ 94,10 đến 98,79%. Tiếp đến là human SARS-CoV2 và human SARS-CoV với tỷ lệ tương đồng 87,68%. Human SARS-CoV2 và bat SARS-CoV, human SARS-CoV2 và bat CoV đều có tỷ lệ tương đồng 85,14%. Điều này cho thấy, Sarbecovirus CoVs có khả năng tiến hóa thay đổi phạm vi vật chủ khác nhau như dơi, tê tê và người

điểm /   đánh giá
Phát hành ngày
2022-08-17
Chuyên mục
CÔNG NGHỆ SINH HỌC