Nghiên cứu xây dựng quy trình kỹ thuật xét nghiệm xác định đột biến gen EGFR ở bệnh nhân ung thư phổi tế bào không nhỏ

Tóm tắt

Mục tiêu: Xây dựng quy trình chuẩn kỹ thuật xét nghiệm xác định đột biến gen EGFR từ mẫu đúc Parafin. Phương pháp: Nghiên cứu mô tả cắt ngang, sử dụng kỹ thuật Realtime-PCR trong quy trình xác định đột biến gen. Sáu mẫu mô đúc paraffin FFPE của bệnh nhân được chẩn đoán ung thư phổi bằng mô bệnh học và đã xác định mang đột biến gen EGFR bằng kỹ thuật Sinh học phân tử được sử dụng cho việc xây dựng quy trình. Áp dụng quy trình phát hiện đột biến gen EGFR sau khi xây dựng trên 109 mẫu đúc paraffin FFPE của bệnh nhân được chẩn đoán ung thư phổi bằng mô bệnh học. Kết quả: Với 4-5 lát cắt cho mỗi mẫu, thu được nồng độ DNA là đảm bảo số lượng và  mẫu đầu vào cho phản ứng khuếch đại gen.  Khi thực hiện ngâm xylen 2 lần liên tiếp với thời gian ngâm mỗi lần là 5’ trong điều kiện lắc và ủ ở 560C, mẫu được loại bỏ hoàn toàn Paraffin đảm bảo độ tinh sạch cho DNA đầu vào của phản ứng khuếch đại gen. Trong 109 mẫu bệnh phẩm đã làm, có 38 mẫu bệnh phẩm dương tính. Trong đó,có 1 mẫu bệnh phẩm dương tính với cả S768I và G719C; L858R chiếm tỷ lệ dương tính cao nhất với 31.58%, tiếp theo là ex19del với 28.95%; G719x và EGFR S768I cùng có tỷ lệ 10.53%; EGFR ex20ins chiếm tỉ lệ 7.89 %, cuối cùng là EGFR T790M và EGFR L861Q chiếm 5.26%. Kết luận: Chuẩn hoá, xây dựng thành công quy trình kỹ thuật xét nghiệm xác định đột biến gen EGFR. Quy trình cho kết quả xét nghiệm có hiệu suất cao hơn, phù hợp với cơ sở vật chất, trang thiết bị tại bệnh viện. Tỉ lệ bệnh nhân UTP xác định định mang đột biến gene EGFR 34,86% là khá cao.  Tỉ lệ dương tính đột biến gen EGFR ở bệnh nhân UTPKTBN là 34,86 %.