Ứng dụng kỹ thuật metagenomics để nhận diện gene mã hóa laccase của nấm Basidiomycetes trong mẫu đất rừng Nam Cát Tiên

Tóm tắt

Theo một số các công trình nghiên cứu hiện nay chỉ có khoảng 0,1-1% vi sinh vật được phát hiện từ việc nuôi cấy truyền thống, như vậy còn lại 99% vi sinh vật trong môi trường tự nhiên chưa được phát hiện chủ yếu là do chúng rất khó nuôi cấy hoặc không thể nuôi cấy được. Nghiên cứu các vi sinh vật mà không cần thông qua bước nuôi cấy là mục tiêu hướng tới của nghiên cứu đa dạng vi sinh hiện đại. Nghiên cứu này được thực hiện theo hướng metagenomics nhằm khảo sát sự đa dạng của gen laccase ở nấm trong mẫu đất rừng Nam Cát Tiên bao gồm các bước thí nghiệm đơn giản, nhanh chóng, chi phí thấp như ly trích và tinh sạch DNA trực tiếp từ đất, sử dụng cặp mồi thoái hóa Cu1F/Cu2R đặc trưng cho nấm đảm, tạo dòng và phân tích trình tự thư viện gen laccase. Chúng tôi đã thành công nhận diện gen laccase từ các mẫu thu được.