TIẾN HÓA DI TRUYỀN CỦA CÁC DÒNG BIẾN THỂ SARS-CoV-2 DỰA TRÊN SURFACE GLYCOPROTEIN

Tóm tắt

Thu thập 35 trình tự surface glycoprotein (S) của các biến thể SARS-CoV-2 từ cơ sở dữ liệu GenBank, Mỹ. Kết quả sắp hàng nhiều trình tự S của các biến thể SARS-CoV-2 nhận diện được 8 dòng biến thể SARS-CoV-2 có mã WHO: Gốc, Alpha, Beta, Gamma, Delta, Delta Plus, Iota, Kappa và 9 dòng biến thể chưa có mã WHO: N1-N9. Các dòng biến thể Delta và Delta Plus có quan hệ tiến hóa gần nhau nhất với khoảng cách 0,00236. Tiếp đến là Iota và Gốc 0,00468, Delta và Gốc 0,00545. Có quan hệ tiến hóa di truyền xa nhau nhất gồm các dòng biến thể Gamma và Delta Plus với khoảng cách 0,01493, Gamma và Delta 0,01324, Gamma và Kappa 0,01253, Alpha và Gamma 0,01178, Beta và Delta Plus 0,01139. Theo hệ thống phân loại SIG cập nhật ngày 01-12-2021, các dòng biến thể Alpha (B.1.1.7), Beta (B.1.351), Gamma (P.1), Iota (B.1.526), Kappa (B.1.617.1) thuộc loại các dòng biến thể đang được theo dõi (VBM), mức độ nghiêm trọng cấp 1. Các dòng biến thể Delta (B.1.617.2), Delta Plus (AY.1) thuộc dòng biến thể đáng lo ngại (VOC), mức độ nghiêm trọng cấp 3