Kết quả nghiên cứu điển hình và kiểu gen kháng kháng sinh của vi khuẩn Escherichia Coli sản sinh ESBL phân lập từ chất thải lợn
Tóm tắt
Vi khuẩn kháng kháng sinh là mối đe dọa đối với sức khỏe cộng đồng trên toàn thế giới và lây truyền gen kháng là cơ chế kháng kháng sinh quan trọng nhất của vi khuẩn. Trong nghiên cứu này, 43 chủng E. coli sản sinh ESBL phân lập từ chất thải của lợn tại Bắc Ninh đã được lựa chọn để giải trình tự gen của chúng bằng phương pháp Illumina Nextera XT sử dụng quy trình v3 của kit thử MiSeq. Kết quả nghiên cứu cho thấy gen kháng kháng sinh phát hiện được từ các chủng vi khuẩn nói trên bao gồm: blaCTX-M-55 (22/43), blaCTX-M-14
(10/43), blaCTX-M-27 (5/43), blaCTX-M-15 (2/43) và blaOXA10 (4/43). Một chủng E. coli sinh ESBL mang gen blaDHA - gen quy định tính kháng kháng sinh beta-lactam nhóm C. 18/43 chủng E. coli sản sinh ESBL
mang gen mcr-1 (kháng colistin). Trong đó có 3 chủng đồng mang gen kháng colistin mcr-3, 2 chủng có đột biến trên gen prmB (p.V161G). 41/43 (95,3%) chủng E. coli sản sinh ESBL đều mang gen kháng nhóm kháng sinh quinolone (qnrS1 hoặc/và các gen kháng qnrB6, qnrB19) qua plasmid (PMQR). Các gen kháng này có thể truyền ngang hoặc truyền dọc giữa các chủng/ loài vi khuẩn khác nhau và đây là một trong những bằng chứng về lây lan gen kháng kháng sinh của vi khuẩn E. coli phân lập từ chất thải của lợn tại Việt Nam