Xây dựng quy trình phân type đa hình đơn nucleotide trên gen IFNL4 có liên quan đến sự thanh thải virus viêm gan C

Tóm tắt

Chúng tôi xây dựng một quy trình phân tử để xác định đa hình đơn nucleotide (Single Nucleotide Polymorphism-SNP) trên gen IFNL4 bằng kỹ thuật real-time PCR với hai Taqman probe đặc hiệu cho mỗi dạng đa hình của ss469415590. Quy trình xây dựng gồm các bước: 1) Tách chiết DNA người từ máu toàn phần; 2) Nhân bản DNA người đã tách chiết trong phản ứng real-time PCR (Polymerase chain reaction) với cặp mồi ss469415590_IFNL4_F và ss469415590_IFNL4_R và hai Taqman probe đặc hiệu cho mỗi dạng đa hình là ss469415590_IFNL4_FAM cho đa hình DG và ss469415590_IFNL4_VIC cho đa hình TT. Quy trình đã xây dựng được đánh giá trên 95 mẫu DNA người và tính được tần số allele TT là 93 % trong khi DG là 7 %. Kết quả so sánh giữa hai phương pháp trên 10 mẫu lâm sàng cho thấy quy trình phân type ss469415590 bằng real-time PCR có độ chính xác là 100 %.