GIẢI TRÌNH TỰ GEN 16S-rRNA CỦA CÁC LOÀI CUA XANH (SCYLLA PARAMAMOSAIN) VÀ XÁC ĐỊNH QUAN HỆ DI TRUYỀN

Tóm tắt

Tách chiết và thu nhận được DNA tổng số của ba loài cua xanh Cần Giờ, Bến Tre, Cà Mau bằng phương pháp trích ly cột silica. Hiệu chỉnh thành công quy trình PCR khuếch đại vùng gen ty thể 16S ribosomal RNA (16S-rRNA) bằng cặp mồi M13U16S-F và M13U16S-R. So sánh trình tự gen 16S-rRNA của cua xanh trên GenBank có độ bao phủ và tương đồng đạt hơn 99% cho thấy mẫu vật thu thập ngoài thực địa không bị lẫn tạp các mẫu khác. Đã xác định được trình tự gen 16S-rRNA của loài cua xanh có kích thước phân tử 511 bp. Trên cơ sở phân tích đặc điểm phân tử đoạn trình tự này, đã định loại ba mẫu cua trên thuộc loài Scylla paramamosain phân bố ở vùng biển Việt Nam. Tiến hành xây dựng cây phát sinh loài và đánh giá quan hệ di truyền của sáu quần thể cua xanh thuộc chi Scylla và ba loài cua thuộc chi khác, kết quả phân loại thành sáu nhóm cua dựa trên trình tự 16S-rRNA.